Derrière le paravent pittoresque de Taiji, ville portuaire du Japon, se cache une réalité troublante : à chaque automne, des braconniers de la mer rapportent jusqu'au rivage des centaines de milliers de dauphins. Une fraction d'entre eux sont triés et vendus à des parcs aquatiques du monde entier. Le reste est transporté dans une lagune isolée, à l'abri des regards, et massacré pour sa viande. Richard O'Barry, qui fut dans les années 1960 l'entraîneur du dauphin qui jouait Flipper dans la télésérie du même nom, a choisi depuis de consacrer sa vie à la protection de ces mammifères marins. Avec l'aide d'une équipe de cinéastes de l'Oceanic Preservation Society, il entend révéler au grand jour ce que les autorités japonaises tolèrent et cachent à Taiji.