James Tiberius Kirk aurait pu passer toute sa vie à se fritter dans les bars et à jouer à cache-cache avec les flics, si seulement il n’était pas le fils de George Kirk, capitaine de vaisseau mort en héros...
Lorsque la responsable de la santé, Elizabeth Driscoll (Brooke Adams), remarque que son amant est devenu étrangement distant, cela déclenche une série de découvertes choquantes qui la voient, ainsi que son collègue Matthew Bennell (Donald Sutherland), fuir pour sauver leur vie au son des bruits perçants des cris extraterrestres.