Impatient de collecter des fonds pour financer les recherches sur sa nouvelle théorie relative à l'intelligence des vélociraptors, le célèbre paléontologue, le Dr Alan Grant (Sam Neil), accepte volontiers d'accompagner un richissime aventurier (William H. Macy) et son épouse (Tea Leoni) lors d'un survol d'Isla Sorna. L'île tristement célèbre, qui fut jadis le Site N d'InGen, est devenue l'un des principaux lieux de reproduction pour les fabuleuses créatures de John Hammond et continue d'attirer quantité d'effrontés rêvant de se mesurer aux sauriens. Lorsque Grant et ses compagnons de voyage échouent sur l'île à la suite d'un tragique accident, le scientifique découvre les réelles motivations de ses hôtes. Les rescapés doivent affronter quelques créatures inédites d'InGen, si bien que Grant aura l'occasion de vérifier à ses dépends la pertinence de ses théories.